Можжевельник казацкий - это низкорослое двудомное растение, характеризующееся распростертой формой роста. Его прирост в основном происходит в ширину, что придает ему пышный вид. Корневая система мощная и способна приспосабливаться к разным типам почв. Каждый год кустарник прибавляет в длину около 5 см, и максимальная высота достигает 4 метров.

Можжевельник казацкий образует небольшие шишко-ягоды, длиной не более 0,5 мм. Эти плоды имеют вытянутую форму и черный цвет с сизым налетом. Их небольшой размер делает их трудно различимыми в густой хвое, и они часто остаются незамеченными для невооруженного глаза. Растение начинает плодоноситься примерно с восьмилетнего возраста.

Можжевельник казацкий также известен своим резким ароматом, который сложно спутать с чем-либо другим. Этот аромат вызван наличием эфирных масел в растении.